槽式發(fā)酵一般是在水泥地面上建間隔墻(為了保溫，北方地區(qū)也有建成下沉式坑槽的)，在間隔墻的頂端鋪設(shè)導(dǎo)軌，翻堆機(jī)在導(dǎo)軌上行走，并設(shè)有換軌機(jī)構(gòu)，翻堆機(jī)可從一條槽移至另一條槽。槽的深度從0.7m至2.5m均有，有些在草地鋪有通氣管，一增加通氣量。

槽式發(fā)酵翻堆機(jī)具有處理量大、占地小、操作簡單、可實(shí)現(xiàn)無人駕駛等優(yōu)點(diǎn)，對要求密封處理、控制環(huán)境的企業(yè)尤為適用。廢氣可集中處理，大、中、小型有機(jī)肥廠均可采用，但因?yàn)橐ú?，造成發(fā)酵場固定，有一定的局限性，透氣性也沒條跺式好。

目前，一些翻堆深度大于1.5m的槽式翻堆機(jī)一般都設(shè)計(jì)有加氧裝置，可增加透氣性，這是一個(gè)很好的改進(jìn)。

對于糞便型、糟渣類和纖維較多、黏性小的發(fā)酵物，可采用具有強(qiáng)力打碎、攪拌作用的翻堆機(jī)，這樣可以省下原料攪拌打碎這些前處理工序，減少生產(chǎn)環(huán)節(jié)。

同時(shí)，每一次的翻堆都是對物料進(jìn)行一次打碎和攪拌，提高了物料的發(fā)酵速度，也使有機(jī)肥物料更均勻，疏松。